RNA-Extraktion aus Vollblut
Bei dem Agencourt RNAdvance Blood System handelt es sich um einen Extraktionsprozess für RNA (Ribonukleinsäure) auf Grundlage von paramagnetischer, bead-basierter Solid Phase Reversible Immobilization (SPRI). Es ermöglicht im Rahmen von Biowissenschaften, hochwertige RNA aus PAXgeneTM Probenröhrchen entnommenem Blut aufzureinigen. Das Kit ist darauf ausgelegt, eine 96-Well-Platte in ungefähr 3,5 Stunden zu verarbeiten.
Explore Aus Blut Models
RNAdvance Blood Workflow Steps
Überblick
Anwendung: Gesamt-RNA-Extraktion aus Blut
Downstream-Anwendungstechniken: Genexpression mittels qRT-PCR und Microarray-Analyse
Prozessüberblick
1. Lysepuffer dem Blut hinzufügen und mischen 2. Lyse und Proteinase K-Digestion 3. Hinzugabe von Bind 1-Puffer 4. Magnetische Trennung der Beads vom Überstand, Waschen mit Waschpuffer und Ethanol 5. DNase I-Reaktion 6. Erneute Bindung mit Bind 2-Puffer 7. Magnetische Trennung der Beads vom Überstand, Waschen mit Waschpuffer und Ethanol 8.ElutionAusgezeichnete Ausbeute und Qualität
In der folgenden Studie (Abbildung 1) erzeugte Agencourt RNAdvance Blood ungefähr 700 ng RNA pro 400 µl PAXgene-Blut; dies entspricht nahezu 17 µg RNA pro Röhrchen PAXgene-konserviertem Blut. Mit dem paramagnetischen, bead-basierten SPRI-Prozess konnte Agencourt RNAdvance Blood über 30 % mehr RNA gewinnen als das PAXgene Blood RNA-Kit und wies dabei eine konsistente Reinheit auf.
Abbildung 1. Durchschnittliche RNA-Ausbeute (in µg/ml) bei 24 400 µl PAXgene-konservierten Blutproben, extrahiert mittels Agencourt RNAdvance Blood-Kit und 9,4 ml PAXgene-konserviertem Blut, extrahiert mit dem PAXgene Blood RNA-Kit. Die durchschnittlichen 260/280-Verhältnisse über die 24 Extraktionen mit Agencourt RNAdvance Blood hinweg betrugen 1,8 bei einer Standardabweichung von 0,13 und %CV von 7,24. Das Elutionsvolumen der Agencourt RNAdvance Blood-Extraktion betrug 20 µl.
Ausgezeichnete Ausbeute und Qualität
In der folgenden Studie (Abbildung 1) erzeugte Agencourt RNAdvance Blood ungefähr 700 ng RNA pro 400 µl PAXgene-Blut; dies entspricht nahezu 17 µg RNA pro Röhrchen PAXgene-konserviertem Blut. Mit dem paramagnetischen, bead-basierten SPRI-Prozess konnte Agencourt RNAdvance Blood über 30 % mehr RNA gewinnen als das PAXgene Blood RNA-Kit und wies dabei eine konsistente Reinheit auf.
Abbildung 1. Durchschnittliche RNA-Ausbeute (in µg/ml) bei 24 400 µl PAXgene-konservierten Blutproben, extrahiert mittels Agencourt RNAdvance Blood-Kit und 9,4 ml PAXgene-konserviertem Blut, extrahiert mit dem PAXgene Blood RNA-Kit. Die durchschnittlichen 260/280-Verhältnisse über die 24 Extraktionen mit Agencourt RNAdvance Blood hinweg betrugen 1,8 bei einer Standardabweichung von 0,13 und %CV von 7,24. Das Elutionsvolumen der Agencourt RNAdvance Blood-Extraktion betrug 20 µl.
Combining RNAdvance Blood chemistry with our Biomek Workstation offers a high throughput and minimal hand-on solution.
Product Specifications
| Application Uses | RNA Isolation, RNA Extraction, Nucleic Acid Sample Prep, RNA Sequencing |
| Format | Liquid |
| Starting Sample Material | Blood |
| Automated Available | Yes |
| Item Specifications Referenced | A35604 |
Citations
Beineke, P., Fitch, K., Tao, H., Elashoff, M. R., Rosenberg, S., Kraus, W. E., . . . PREDICT Investigators. (2012, December 3). A whole blood gene expression-based signature for smoking status. BMC Medical Genomics, 5(58). doi:10.1186/1755-8794-5-58
- Used to extract RNA from PAXgene-collected blood samples
Allaire, N. E., Bushnell, S. E., Bienkowska, J., Brock, G., & Carulli, J. (2013, January 5). Optimization of a high-throughput whole blood expression profiling methodology and its application to assess the pharmacodynamics of interferon (IFN) beta-1a or polyethylene glycol-conjugated IFN beta-1a in healthy clinical trial subjects. BMC Research Notes, 6(8). doi:10.1186/1756-0500-6-8
- Used to extract RNA from PAXgene-collected blood samples
Disclaimer: Beckman Coulter makes no warranties of any kind whatsoever express or implied, with respect to this protocol, including but not limited to warranties of fitness for a particular purpose or merchantability or that the protocol is non-infringing. All warranties are expressly disclaimed. Your use of the method is solely at your own risk, without recourse to Beckman Coulter. Not intended or validated for use in the diagnosis of disease or other conditions. This protocol is for demonstration only, and is not validated by Beckman Coulter.
