AMPure XP für die PCR-Aufreinigung

Cleanup und Größenauswahl

Sie können unsere eigens entwickelte paramagnetische SPRI-Bead-basierte Chemie verwenden, um Kontaminanten (dNTPs, Salze, Primer, Primerdimere) in Ihren NGS-Workflows zu entfernen.

  • Wird in einer Vielzahl von NGS-Bibliotheksvorbereitungschemien verwendet
  • Kompatibel mit manueller und automatischer Verarbeitung
  • Hohe Ausbeute von Amplikons größer als 100 BP
  • Vorhersehbare und konsistente Auswahl an Größen

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AMPure XP Arbeitsablauf

AMPure XP Arbeitsablauf

Produktspezifikationen

Application Uses Purification & Clean-up, PCR Purification, DNA Purification, Sequencing, NGS Clean-up, PCR clean-up
Format Liquid
Starting Sample Material DNA
Automated Available Yes
Item Specifications Referenced A63882


Zitierungen

Peffers, M. J., Liu, X., & Clegg, P. D. (2014, March 8). Transcriptomic profiling of cartilage ageing. Genomics Data, 2, 27-28. doi:10.1016/j.gdata.2014.03.0011

  • Zum Cleanup von cDNA verwendet

Greenwald, W. W., Li, H., Benaglio, P., Jakubosky, D., Matsui, H., Schmitt, A., . . . Frazer, K. A. (5. März 2019). Subtle changes in chromatin loop contact propensity are associated with differential gene regulation and expression. Nature Communications, 10(1054), 1-17. doi:https://doi.org/10.1038/s41467-019-08940-51

  • Zum Cleanup von PCR-Reaktionen mit Strichcode während der Bibliotheksvorbereitung verwendet


Kein Verlust kritischer Daten

Wenn so viel mehr in Ihre Forschung investiert wurde, ist AMPure XP die einzige Wahl für Reinigungs- und Cleanup-Schritte. Ertragsverluste während dieses kritischen Schritts führen zu Entdeckungsverlusten in Ihrer Forschung.

Relative Kosten der verschiedenen Schritte, die zur Durchführung verschiedener NGS-Anwendungen erforderlich sind. Zu den Schritten gehören Extraktion, Bibliotheksaufbau, Bibliotheksanreicherung, Cleanup und Sequenzierung. Die Kosten wurden auf der Grundlage des durchschnittlichen Listenpreises von kommerziell erhältlichen Kits und Reagenzien im Jahr 2017 berechnet. Die Cleanup-Effizienz wurde durch Bestimmung der Gesamt-DNA-Ausbeute mittels Picogreen-Assay nach Durchführung eines Cleanup-Verfahrens an einer bekannten DNA-Menge berechnet. Die prozentuale Ausbeute im Verhältnis zur Leistung von AMPure XP wurde dann verwendet, um die Auswirkungen der Effizienz auf verschiedene kommerziell verfügbare Bibliothekskonstruktionsmethoden und einen Wechsel des Cleanup-Reagenzes zu berechnen.

AMPure XP – Kritische Daten für Downstream-Anwendungen erhalten



AMPure XP ist der Goldstandard für die Bead-basierte Next-Generation Sequenzierung (oder NGS) das Cleanup

Mehr als 200 Bibliotheksvorbereitungs-Kits schlagen die Verwendung von AMPure XP vor, darunter auch Kits von angesehenen Sequenzierunternehmen, wie:

  • Illumina®
  • Nanopore
  • PacBio
  • Thermo Scientific

Über 15.000 Publikationen verwendeten AMPure XP, auf die in Artikeln in Science, Nature und PNAS verwiesen wird.

Die Reinigung und Aufbereitung von Nukleinsäuren ist für genomische Anwendungen obligatorisch, einschließlich Sequenzierung, qPCR/ddPCR/PCR und Mikroassays. Durch Maximierung der Wiederfindung, Konsistenz und Geschwindigkeit erfüllt AMPure XP die hohen Anforderungen der heutigen genomischen Anwendungen und minimiert das Risiko für den Verlust wichtiger genetischer Informationen.

  • Hohe Ausbeute von Amplikons größer als 100 BP
  • Effiziente Entfernung von nicht aufgenommenen DNTPs, Primers, Primer-Dimeren, Salzen und anderen Verunreinigungen
  • Vorhersehbare und konsistente Auswahl an Größen

„Unsere Ergebnisse legen nahe, dass AMPure XP die beste Wahl für Analysen ist, bei der eine sehr hohe analytische Strenge erforderlich ist.“ Mikheikin, A., Olsen, A., Picco, L. et al. High-speed atomic force microscopy revealing contamination in DNA purification systems. Anal. Chem. 88:5, 2527-2523 (2016) doi: 10.1021/acs.analchem.5b04023.1

1 Haftungsausschluss: Beckman Coulter gibt keinerlei ausdrückliche oder stillschweigende Garantien jeglicher Art in Bezug auf dieses Protokoll, einschließlich, aber nicht beschränkt auf Garantien der Eignung für einen bestimmten Zweck oder der Marktgängigkeit oder dass das Protokoll keine Rechtsverletzung darstellt. Jegliche Gewährleistungen werden hiermit ausdrücklich ausgeschlossen. Die Anwendung der Methode erfolgt ausschließlich auf Ihr eigenes Risiko, ohne Rückgriff auf Beckman Coulter. Nicht für den Gebrauch in der Diagnose von Krankheiten oder sonstiger Gesundheitszustände gedacht oder validiert. Dieses Protokoll dient nur zur Demonstration und wird nicht von Beckman Coulter validiert.

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