Einzelzell-Genomik

Low-Volume-Sequenzierungsbibliotheken aus Einzelzellen

Echo Liquid Handler miniaturisieren die Bibliothekerstellung für die Gesamtgenom- und Transkriptomanalyse von Genmaterial aus Einzelzellen. Dank des präzisen, genauen und kontaktlosen Transfers können Echo-Systeme die Mehrfachverdrängungs-Amplifikation (MDA) und RNA-Sequenzierungsreaktionen um mindestens 75% reduzieren. Bibliotheken für die Next-Generation-Sequenzierung (NGS) von RNA oder DNA können auf 10µL oder weniger reduziert werden.

Reaktionsvolumina reduzieren und das Kreuzkontaminationsrisiko eliminieren

Die Einzelzell-Genomik ist für das Verständnis genetischer und epigenetischer Variationen, die während des gesamten Lebens eines Organismus auftreten, unerlässlich. Beispielsweise setzen Krebsforschungsprogramme auf die Einzelzell-Genomik, um die Herausforderungen mit Daten aus heterogenen Tumorproben zu meistern, indem sie einzelne Zelltypen innerhalb einer Population und seltene Zellereignisse untersuchen.

Die Amplifikation von DNA aus einer Einzelzelle ist von Natur aus anfällig für Kontaminationen. Exogene DNA aus Spitzen oder Düsen, die beim Transfer von Proben oder Reagenzien in eine PCR-Reaktion verwendet werden, kann nicht einmal mit UV-Bestrahlung vor dem Transfer aufgelöst werden. Durch den kontaktlosen akustischen Transfer mit dem Echo Liquid Handler wird der Kontakt mit der DNA vermieden und damit das Risiko der Kreuzkontamination drastisch verringert. Die Präzision und Genauigkeit des Transfers bei niedrigen Nanolitervolumina macht wiederholte Experimente überflüssig, wodurch die Reagenzienkosten weiter gesenkt werden.

Durch die Nutzung der akustischen Transfermöglichkeiten in Verbindung mit den Bibliothekerstellungskits für die RNA- oder DNA-Sequenzierung können Forscher die Anzahl der pro Kit generierten Bibliotheken drastisch erhöhen. Durch die Reduzierung des Transfervolumens um mindestens 75% und die Bündelung von Bibliotheken für die Sequenzierung ohne iterative Verdünnungen können Echo-Systeme die Bibliotheken, die aus Einzelzellen hergestellt werden, miniaturisieren und qualitativ verbessern.

Wesentliche Vorteile

  • Reduzierte Betriebskosten durch effiziente Assay-Miniaturisierung
  • Eliminierung von Kreuzkontamination
  • Verbesserte Datenqualität mit Assay-Volumina von nur 250 nL
  • Auf genomische Assays zugeschnittene integrierte Systeme und Software

Genomic Reagents Portfolio

Our reagents are powered by Solid Phase Reversible Immobilization or SPRI technology, which uses SPRI paramagnetic beads to selectively bind nucleic acids by size. It’s ideal for nucleic acid extraction from cells, tissue, blood and even challenging formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) samples.

Flow Cytometry

The power of high dimensional single-cell analysis and software that streamlines instrumentation operation without compromising performance.

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